Finalment el futur de Javier Aguirre serà lluny de la banqueta blanc-i-blava. L'entrenador mexicà no renovarà amb el club per a la propera temporada. L'encara entrenador i el president de l'entitat, Joan Collet, ho han anunciat després de l'entrenament d'aquest divendres. Després de les converses amb el director esportiu, Òscar Perarnau, Aguirre i el club han arribat a un acord mutu per desvincular el tècnic de l'Espanyol després de dues temporades a la banqueta. JAVIER AGUIRRE, entrenador del RCD Espanyol "Fue un aspecto que hasta ayer o antes de ayer lo decidimos, yo estoy feliz lo dije hace cuatro dias, estoy feliz en la institución, estoy feliz en Barcelona pero consideramos ambas partes pues que es bueno para nosotros pues terminar la relación." "Estamos convencidos de que es lo mejor en este momento, no hay ningún trauma, ninguna cosa más allá de eso, ninguna cosa extraña, ningún detonante ni historia. Fuimos frontales del primer día, al último." El mexicà dirigirà l'últim partit de Lliga al Bernabéu contra el Madrid i dimecres la final de la Copa Catalunya a Girona contra el Barça.

Javier Aguirre va ser presentat el 29 de novembre de 2012 per substituir Mauricio Pochettino, que havia deixat l’equip com a cuer de la Primera Divisió. L’entrenador mexicà va començar amb bon peu i va aconseguir salvar l’Espanyol del descens. Fins i tot va tenir opcions de jugar a Europa. Tot i un final de Lliga molt dolent, la directiva el va renovar.

Aquesta temporada, amb la marxa de jugadors importants i el fitxatge de jugadors de perfil baix, ha aconseguit mantenir el conjunt en la zona tranquil·la i fins i tot, en alguns moments, apropar-se a la zona europea. Tot i això, el final de temporada ha estat nefast, amb només dos punts en els últims set enfrontaments.